Баткенская область долгое время сталкивалась с рядом препятствий для развития. Исторически регион страдал от экономической изоляции, слабой транспортной связи с другими частями Кыргызстана и постоянной напряженности, связанной со спорными границами с Таджикистаном и Узбекистаном. Эти факторы, наряду с социальными проблемами, замедляли развитие региона на протяжении многих десятилетий.
В прошлом в западной части страны были закрыты многочисленные заводы и фабрики, а также заброшены шахты и рудники. Это привело к тому, что значительная часть местного населения вынуждена была покинуть родные места и искать заработок за границей.
